Protein–RNA interactions for Protein: Q5NUL3

FFAR4, Free fatty acid receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FFAR4Q5NUL3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FFAR4Q5NUL3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FFAR4Q5NUL3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms