Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NECTIN1Q15223 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms