Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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