Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLFN5Q08AF3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms