Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC37.96■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC37.95■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC37.91■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC37.9■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
ERCC6Q03468 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC37.86■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms