Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL11P62913 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL11P62913 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL11P62913 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL11P62913 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL11P62913 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL11P62913 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL11P62913 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL11P62913 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL11P62913 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL11P62913 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL11P62913 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL11P62913 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL11P62913 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL11P62913 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL11P62913 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL11P62913 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL11P62913 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL11P62913 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL11P62913 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL11P62913 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL11P62913 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL11P62913 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL11P62913 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL11P62913 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL11P62913 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL11P62913 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL11P62913 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL11P62913 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL11P62913 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL11P62913 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL11P62913 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL11P62913 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL11P62913 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL11P62913 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL11P62913 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL11P62913 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL11P62913 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL11P62913 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL11P62913 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL11P62913 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL11P62913 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL11P62913 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL11P62913 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL11P62913 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL11P62913 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL11P62913 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL11P62913 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL11P62913 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL11P62913 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL11P62913 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL11P62913 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL11P62913 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL11P62913 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL11P62913 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL11P62913 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL11P62913 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL11P62913 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL11P62913 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL11P62913 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL11P62913 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL11P62913 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL11P62913 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL11P62913 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL11P62913 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL11P62913 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL11P62913 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL11P62913 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL11P62913 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL11P62913 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL11P62913 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL11P62913 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL11P62913 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL11P62913 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL11P62913 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL11P62913 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL11P62913 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL11P62913 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL11P62913 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL11P62913 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL11P62913 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL11P62913 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL11P62913 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL11P62913 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL11P62913 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL11P62913 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL11P62913 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL11P62913 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL11P62913 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL11P62913 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL11P62913 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL11P62913 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL11P62913 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL11P62913 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL11P62913 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL11P62913 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL11P62913 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL11P62913 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL11P62913 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL11P62913 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms