Protein–RNA interactions for Protein: P61601

NCALD, Neurocalcin-delta, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCALDP61601 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCALDP61601 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCALDP61601 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCALDP61601 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCALDP61601 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCALDP61601 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCALDP61601 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCALDP61601 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCALDP61601 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCALDP61601 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCALDP61601 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCALDP61601 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCALDP61601 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCALDP61601 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCALDP61601 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCALDP61601 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCALDP61601 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCALDP61601 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCALDP61601 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCALDP61601 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCALDP61601 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCALDP61601 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCALDP61601 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCALDP61601 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCALDP61601 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NCALDP61601 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCALDP61601 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCALDP61601 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCALDP61601 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCALDP61601 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NCALDP61601 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NCALDP61601 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCALDP61601 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCALDP61601 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCALDP61601 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NCALDP61601 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCALDP61601 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCALDP61601 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NCALDP61601 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCALDP61601 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCALDP61601 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCALDP61601 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NCALDP61601 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCALDP61601 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NCALDP61601 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCALDP61601 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCALDP61601 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCALDP61601 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCALDP61601 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCALDP61601 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NCALDP61601 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCALDP61601 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCALDP61601 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NCALDP61601 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCALDP61601 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCALDP61601 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCALDP61601 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCALDP61601 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCALDP61601 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NCALDP61601 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCALDP61601 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCALDP61601 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCALDP61601 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCALDP61601 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCALDP61601 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NCALDP61601 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCALDP61601 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCALDP61601 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCALDP61601 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCALDP61601 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCALDP61601 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCALDP61601 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCALDP61601 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NCALDP61601 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NCALDP61601 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NCALDP61601 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCALDP61601 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCALDP61601 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NCALDP61601 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCALDP61601 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NCALDP61601 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCALDP61601 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCALDP61601 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NCALDP61601 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCALDP61601 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NCALDP61601 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NCALDP61601 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NCALDP61601 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCALDP61601 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCALDP61601 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NCALDP61601 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCALDP61601 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NCALDP61601 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCALDP61601 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NCALDP61601 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCALDP61601 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCALDP61601 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NCALDP61601 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NCALDP61601 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCALDP61601 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms