Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2MP61081 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms