Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms