Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3BP55884 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms