Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX2P40425 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX2P40425 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX2P40425 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX2P40425 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX2P40425 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX2P40425 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX2P40425 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX2P40425 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX2P40425 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX2P40425 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX2P40425 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX2P40425 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX2P40425 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX2P40425 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX2P40425 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX2P40425 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX2P40425 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX2P40425 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX2P40425 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX2P40425 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX2P40425 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PBX2P40425 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX2P40425 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX2P40425 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX2P40425 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX2P40425 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX2P40425 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX2P40425 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX2P40425 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX2P40425 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX2P40425 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX2P40425 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX2P40425 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX2P40425 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX2P40425 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX2P40425 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX2P40425 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX2P40425 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX2P40425 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX2P40425 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX2P40425 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX2P40425 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX2P40425 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX2P40425 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX2P40425 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX2P40425 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX2P40425 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX2P40425 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX2P40425 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX2P40425 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX2P40425 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX2P40425 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX2P40425 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX2P40425 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX2P40425 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX2P40425 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX2P40425 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX2P40425 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX2P40425 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX2P40425 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX2P40425 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX2P40425 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX2P40425 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX2P40425 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX2P40425 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX2P40425 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX2P40425 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX2P40425 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX2P40425 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX2P40425 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX2P40425 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX2P40425 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX2P40425 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX2P40425 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX2P40425 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX2P40425 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX2P40425 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX2P40425 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX2P40425 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX2P40425 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX2P40425 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX2P40425 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX2P40425 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX2P40425 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX2P40425 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PBX2P40425 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PBX2P40425 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PBX2P40425 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PBX2P40425 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PBX2P40425 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PBX2P40425 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PBX2P40425 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PBX2P40425 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PBX2P40425 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PBX2P40425 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PBX2P40425 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PBX2P40425 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PBX2P40425 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PBX2P40425 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms