Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PSMB9P28065 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms