Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAMP1P23763 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms