Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPGDP15428 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPGDP15428 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPGDP15428 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPGDP15428 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPGDP15428 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPGDP15428 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HPGDP15428 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPGDP15428 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPGDP15428 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPGDP15428 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPGDP15428 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPGDP15428 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPGDP15428 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPGDP15428 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPGDP15428 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPGDP15428 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPGDP15428 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPGDP15428 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPGDP15428 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPGDP15428 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPGDP15428 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HPGDP15428 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPGDP15428 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPGDP15428 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPGDP15428 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPGDP15428 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPGDP15428 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPGDP15428 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPGDP15428 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPGDP15428 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPGDP15428 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPGDP15428 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HPGDP15428 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPGDP15428 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPGDP15428 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPGDP15428 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPGDP15428 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPGDP15428 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HPGDP15428 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPGDP15428 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPGDP15428 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HPGDP15428 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPGDP15428 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HPGDP15428 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPGDP15428 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPGDP15428 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPGDP15428 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPGDP15428 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPGDP15428 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPGDP15428 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPGDP15428 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPGDP15428 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPGDP15428 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPGDP15428 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPGDP15428 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPGDP15428 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPGDP15428 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HPGDP15428 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HPGDP15428 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPGDP15428 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPGDP15428 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPGDP15428 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPGDP15428 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPGDP15428 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HPGDP15428 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPGDP15428 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPGDP15428 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPGDP15428 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPGDP15428 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPGDP15428 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPGDP15428 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPGDP15428 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPGDP15428 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPGDP15428 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPGDP15428 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPGDP15428 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPGDP15428 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPGDP15428 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPGDP15428 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPGDP15428 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPGDP15428 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPGDP15428 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPGDP15428 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPGDP15428 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPGDP15428 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPGDP15428 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPGDP15428 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPGDP15428 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPGDP15428 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPGDP15428 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPGDP15428 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPGDP15428 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPGDP15428 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPGDP15428 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPGDP15428 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPGDP15428 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPGDP15428 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPGDP15428 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HPGDP15428 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms