Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACTN4O43707 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms