Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AL606534.6-201ENST00000611420 1838 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 UHRF2P1-201ENST00000431339 2387 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 SLC43A3-202ENST00000395123 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 JRKL-201ENST00000332349 2855 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 FBXO34-202ENST00000440021 2831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 WFS1-201ENST00000226760 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 MASTL-202ENST00000375940 3080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 SEC14L2-202ENST00000405717 1733 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 GPRASP2-204ENST00000535209 3847 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 SIRPB1-202ENST00000279477 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 CTCFL-209ENST00000433949 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 CYBRD1-202ENST00000375252 3540 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 NOP2-203ENST00000399466 2701 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 KCNJ3-203ENST00000544049 4523 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 SGCE-201ENST00000265735 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 CEPT1-201ENST00000357172 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 PDLIM5-206ENST00000437932 5713 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 FIRRE-201ENST00000427391 2926 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 KCNQ3-201ENST00000388996 11510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 RPAP1-201ENST00000304330 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 DUXAP8-202ENST00000413768 2102 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 SEPT4-204ENST00000412945 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AC073585.1-201ENST00000368895 1328 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AC104791.2-201ENST00000623323 2525 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 HDAC2-205ENST00000519065 9874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 LHX4-201ENST00000263726 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 SMAD9-202ENST00000379826 5592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 WTAP-202ENST00000358372 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 HHAT-202ENST00000367009 2714 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 LMOD3-202ENST00000475434 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 Z98259.3-202ENST00000641860 2210 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 POLR2M-202ENST00000380557 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ZNF621-203ENST00000403205 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 DDR1-227ENST00000376570 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 HNRNPA1P8-201ENST00000436090 951 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 HNRNPA1P7-201ENST00000521273 963 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 Metazoa_SRP.47-201ENST00000616942 279 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AC010729.1-201ENST00000413960 1746 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 POTEB-202ENST00000439682 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
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LSAMPQ13449 DNAJB5-210ENST00000545841 3068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ST6GALNAC1-201ENST00000156626 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 CLTC-215ENST00000621829 8587 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ALDH7A1-228ENST00000636886 2321 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 SLC14A2-201ENST00000255226 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 LUZP1-201ENST00000302291 8898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 SLC39A14-203ENST00000359741 4641 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 FAM19A2-201ENST00000416284 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ZNF594-202ENST00000575779 4335 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 EEF2-201ENST00000309311 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ZNF266-202ENST00000588221 3503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 DOCK10-201ENST00000258390 7260 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 LACC1-201ENST00000325686 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 CCDC175-201ENST00000281581 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 MDM1-204ENST00000411698 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 KYAT3-201ENST00000260508 2070 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 PRDX1-202ENST00000319248 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
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