Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM10Q9UDY6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms