Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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