Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC2

KCNK9, Potassium channel subfamily K member 9, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK9Q9NPC2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNK9Q9NPC2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNK9Q9NPC2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNK9Q9NPC2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNK9Q9NPC2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNK9Q9NPC2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNK9Q9NPC2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNK9Q9NPC2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNK9Q9NPC2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNK9Q9NPC2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNK9Q9NPC2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNK9Q9NPC2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNK9Q9NPC2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNK9Q9NPC2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNK9Q9NPC2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNK9Q9NPC2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNK9Q9NPC2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNK9Q9NPC2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNK9Q9NPC2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNK9Q9NPC2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNK9Q9NPC2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNK9Q9NPC2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNK9Q9NPC2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms