Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCC2Q9HCC0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCCC2Q9HCC0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCCC2Q9HCC0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCCC2Q9HCC0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCCC2Q9HCC0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCCC2Q9HCC0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCCC2Q9HCC0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCCC2Q9HCC0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCCC2Q9HCC0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCCC2Q9HCC0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCC2Q9HCC0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCC2Q9HCC0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCC2Q9HCC0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCC2Q9HCC0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCC2Q9HCC0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCC2Q9HCC0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCC2Q9HCC0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCC2Q9HCC0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCC2Q9HCC0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCC2Q9HCC0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCC2Q9HCC0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCC2Q9HCC0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCC2Q9HCC0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCC2Q9HCC0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCC2Q9HCC0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCC2Q9HCC0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCC2Q9HCC0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCC2Q9HCC0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCC2Q9HCC0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCC2Q9HCC0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCC2Q9HCC0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCC2Q9HCC0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCC2Q9HCC0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCCC2Q9HCC0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCCC2Q9HCC0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCCC2Q9HCC0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MCCC2Q9HCC0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCCC2Q9HCC0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCCC2Q9HCC0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms