Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms