Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED4Q96RK1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms