Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms