Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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COPS9Q8WXC6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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