Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ANKRD42Q8N9B4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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