Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUC0

TFAP2E, Transcription factor AP-2-epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2EQ6VUC0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFAP2EQ6VUC0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFAP2EQ6VUC0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFAP2EQ6VUC0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFAP2EQ6VUC0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFAP2EQ6VUC0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TFAP2EQ6VUC0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFAP2EQ6VUC0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAP2EQ6VUC0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms