Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZCCHC12Q6PEW1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZCCHC12Q6PEW1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZCCHC12Q6PEW1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZCCHC12Q6PEW1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC12Q6PEW1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC12Q6PEW1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC12Q6PEW1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC12Q6PEW1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC12Q6PEW1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC12Q6PEW1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC12Q6PEW1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC12Q6PEW1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC12Q6PEW1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC12Q6PEW1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms