Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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