Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HDAC1Q13547 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
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