Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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SKP2Q13309 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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SKP2Q13309 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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SKP2Q13309 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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SKP2Q13309 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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