Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.173e-6■■■■■ 28.7
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TARDBPQ13148 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.213e-6■■■■■ 28.7
TARDBPQ13148 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.333e-6■■■■■ 28.7
TARDBPQ13148 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.273e-8■■■■■ 28.7
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TARDBPQ13148 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.59e-8■■■■■ 28.7
TARDBPQ13148 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.789e-8■■■■■ 28.7
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TARDBPQ13148 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 28.6
TARDBPQ13148 NPHP4-208ENST00000478423 4467 ntTSL 213.8□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 28.6
TARDBPQ13148 NPHP4-203ENST00000378169 4213 ntTSL 1 (best)12.8□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 28.6
TARDBPQ13148 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.311e-7■■■■■ 28.6
TARDBPQ13148 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.391e-7■■■■■ 28.6
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TARDBPQ13148 ALDH1A2-204ENST00000537372 3700 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 28.5
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TARDBPQ13148 ALDH1A2-207ENST00000558231 1664 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.822e-6■■■■■ 28.5
TARDBPQ13148 ALDH1A2-203ENST00000430119 3049 ntTSL 29.75□□□□□ -0.852e-6■■■■■ 28.5
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TARDBPQ13148 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.285e-10■■■■■ 28.5
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TARDBPQ13148 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.385e-10■■■■■ 28.5
TARDBPQ13148 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 28.5
TARDBPQ13148 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.189e-8■■■■■ 28.5
TARDBPQ13148 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.189e-8■■■■■ 28.5
TARDBPQ13148 DLG4-204ENST00000447163 763 ntTSL 515.66■□□□□ 0.19e-8■■■■■ 28.5
TARDBPQ13148 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.29e-8■■■■■ 28.5
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TARDBPQ13148 PISD-214ENST00000478893 1056 ntTSL 217.96■□□□□ 0.471e-8■■■■■ 28.5
TARDBPQ13148 PISD-213ENST00000474017 1760 ntTSL 516.41■□□□□ 0.221e-8■■■■■ 28.5
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TARDBPQ13148 PISD-208ENST00000437808 2264 ntTSL 511.34□□□□□ -0.591e-8■■■■■ 28.5
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TARDBPQ13148 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.733e-8■■■■■ 28.5
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TARDBPQ13148 SMAD3-211ENST00000559460 568 ntTSL 410.41□□□□□ -0.744e-8■■■■■ 28.5
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TARDBPQ13148 HIPK2-201ENST00000342645 2937 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.032e-7■■■■■ 28.5
TARDBPQ13148 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.362e-7■■■■■ 28.5
TARDBPQ13148 SMAP2-202ENST00000372718 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)16.91■□□□□ 0.35e-10■■■■■ 28.4
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TARDBPQ13148 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.681e-6■■■■■ 28.4
TARDBPQ13148 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.341e-6■■■■■ 28.4
TARDBPQ13148 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 28.4
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TARDBPQ13148 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 28.4
TARDBPQ13148 HNRNPLL-201ENST00000272249 2190 ntTSL 25.67□□□□□ -1.51e-6■■■■■ 28.4
TARDBPQ13148 ANKHD1-207ENST00000421134 4814 ntTSL 518.05■□□□□ 0.482e-10■■■■■ 28.4
TARDBPQ13148 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.032e-10■■■■■ 28.4
TARDBPQ13148 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -02e-10■■■■■ 28.4
TARDBPQ13148 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.242e-10■■■■■ 28.4
TARDBPQ13148 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.279e-7■■■■■ 28.4
TARDBPQ13148 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.029e-7■■■■■ 28.4
TARDBPQ13148 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.813e-16■■■■■ 28.4
TARDBPQ13148 SIAH1-207ENST00000568007 2683 ntTSL 1 (best)11.41□□□□□ -0.583e-16■■■■■ 28.4
TARDBPQ13148 SIAH1-201ENST00000356721 2415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.883e-16■■■■■ 28.4
TARDBPQ13148 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.19□□□□□ -1.583e-16■■■■■ 28.4
TARDBPQ13148 SIAH1-205ENST00000565620 477 ntTSL 24.35□□□□□ -1.713e-16■■■■■ 28.4
TARDBPQ13148 HIP1-204ENST00000434438 7066 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.891e-7■■■■■ 28.4
TARDBPQ13148 HIP1-201ENST00000336926 8013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.011e-7■■■■■ 28.4
TARDBPQ13148 HIP1-206ENST00000485723 419 ntTSL 28.69□□□□□ -1.021e-7■■■■■ 28.4
TARDBPQ13148 AKIRIN1-204ENST00000531822 718 ntTSL 510.11□□□□□ -0.796e-35■■■■■ 28.4
TARDBPQ13148 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.636e-9■■■■■ 28.3
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