Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms