Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RPS28P62857 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RPS28P62857 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RPS28P62857 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RPS28P62857 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RPS28P62857 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RPS28P62857 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RPS28P62857 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RPS28P62857 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RPS28P62857 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RPS28P62857 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RPS28P62857 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RPS28P62857 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS28P62857 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS28P62857 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS28P62857 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS28P62857 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS28P62857 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS28P62857 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS28P62857 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS28P62857 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS28P62857 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS28P62857 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS28P62857 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS28P62857 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS28P62857 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS28P62857 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS28P62857 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS28P62857 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS28P62857 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS28P62857 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS28P62857 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS28P62857 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS28P62857 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS28P62857 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS28P62857 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS28P62857 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS28P62857 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS28P62857 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS28P62857 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS28P62857 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS28P62857 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS28P62857 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS28P62857 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS28P62857 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS28P62857 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS28P62857 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS28P62857 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS28P62857 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS28P62857 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS28P62857 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS28P62857 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS28P62857 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS28P62857 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS28P62857 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS28P62857 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS28P62857 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RPS28P62857 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RPS28P62857 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RPS28P62857 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RPS28P62857 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RPS28P62857 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RPS28P62857 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RPS28P62857 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
RPS28P62857 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RPS28P62857 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RPS28P62857 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RPS28P62857 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RPS28P62857 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RPS28P62857 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RPS28P62857 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RPS28P62857 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RPS28P62857 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RPS28P62857 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RPS28P62857 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RPS28P62857 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS28P62857 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS28P62857 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS28P62857 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS28P62857 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS28P62857 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS28P62857 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS28P62857 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS28P62857 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS28P62857 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS28P62857 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS28P62857 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS28P62857 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS28P62857 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS28P62857 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS28P62857 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS28P62857 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS28P62857 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS28P62857 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS28P62857 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS28P62857 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS28P62857 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS28P62857 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
RPS28P62857 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
RPS28P62857 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms