Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTBP60709 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTBP60709 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTBP60709 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTBP60709 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTBP60709 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTBP60709 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTBP60709 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ACTBP60709 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTBP60709 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTBP60709 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTBP60709 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTBP60709 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTBP60709 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTBP60709 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTBP60709 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTBP60709 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTBP60709 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTBP60709 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTBP60709 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTBP60709 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTBP60709 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTBP60709 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTBP60709 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTBP60709 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTBP60709 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTBP60709 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTBP60709 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTBP60709 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTBP60709 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTBP60709 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTBP60709 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTBP60709 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTBP60709 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTBP60709 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTBP60709 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTBP60709 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTBP60709 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTBP60709 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTBP60709 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTBP60709 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTBP60709 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTBP60709 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTBP60709 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTBP60709 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTBP60709 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTBP60709 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTBP60709 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTBP60709 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTBP60709 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTBP60709 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTBP60709 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTBP60709 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTBP60709 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTBP60709 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTBP60709 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTBP60709 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTBP60709 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTBP60709 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTBP60709 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTBP60709 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTBP60709 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTBP60709 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTBP60709 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTBP60709 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTBP60709 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTBP60709 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTBP60709 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTBP60709 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTBP60709 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTBP60709 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTBP60709 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTBP60709 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTBP60709 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTBP60709 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTBP60709 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTBP60709 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTBP60709 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACTBP60709 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ACTBP60709 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACTBP60709 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACTBP60709 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACTBP60709 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ACTBP60709 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACTBP60709 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACTBP60709 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACTBP60709 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ACTBP60709 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACTBP60709 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ACTBP60709 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACTBP60709 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ACTBP60709 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ACTBP60709 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ACTBP60709 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ACTBP60709 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ACTBP60709 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACTBP60709 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACTBP60709 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACTBP60709 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACTBP60709 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms