Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms