Protein–RNA interactions for Protein: P40429

RPL13A, 60S ribosomal protein L13a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP40429 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL13AP40429 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL13AP40429 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL13AP40429 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL13AP40429 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL13AP40429 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL13AP40429 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL13AP40429 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL13AP40429 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL13AP40429 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL13AP40429 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL13AP40429 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL13AP40429 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL13AP40429 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL13AP40429 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL13AP40429 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL13AP40429 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL13AP40429 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL13AP40429 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL13AP40429 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL13AP40429 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL13AP40429 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPL13AP40429 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL13AP40429 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPL13AP40429 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL13AP40429 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL13AP40429 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL13AP40429 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL13AP40429 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL13AP40429 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL13AP40429 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL13AP40429 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL13AP40429 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL13AP40429 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL13AP40429 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL13AP40429 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL13AP40429 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL13AP40429 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL13AP40429 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL13AP40429 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL13AP40429 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RPL13AP40429 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RPL13AP40429 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPL13AP40429 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPL13AP40429 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPL13AP40429 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RPL13AP40429 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL13AP40429 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL13AP40429 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL13AP40429 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL13AP40429 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL13AP40429 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL13AP40429 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL13AP40429 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL13AP40429 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL13AP40429 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL13AP40429 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL13AP40429 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL13AP40429 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL13AP40429 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL13AP40429 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL13AP40429 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL13AP40429 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL13AP40429 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL13AP40429 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RPL13AP40429 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL13AP40429 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RPL13AP40429 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL13AP40429 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL13AP40429 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL13AP40429 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL13AP40429 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL13AP40429 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL13AP40429 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL13AP40429 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL13AP40429 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL13AP40429 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL13AP40429 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL13AP40429 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL13AP40429 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL13AP40429 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL13AP40429 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL13AP40429 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL13AP40429 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL13AP40429 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL13AP40429 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RPL13AP40429 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL13AP40429 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL13AP40429 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL13AP40429 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL13AP40429 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL13AP40429 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL13AP40429 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL13AP40429 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL13AP40429 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL13AP40429 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL13AP40429 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL13AP40429 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL13AP40429 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL13AP40429 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms