Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
THBS4P35443 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
THBS4P35443 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
THBS4P35443 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
THBS4P35443 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
THBS4P35443 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
THBS4P35443 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
THBS4P35443 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
THBS4P35443 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
THBS4P35443 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
THBS4P35443 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
THBS4P35443 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
THBS4P35443 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
THBS4P35443 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
THBS4P35443 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
THBS4P35443 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
THBS4P35443 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
THBS4P35443 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
THBS4P35443 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
THBS4P35443 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
THBS4P35443 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
THBS4P35443 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
THBS4P35443 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
THBS4P35443 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
THBS4P35443 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
THBS4P35443 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
THBS4P35443 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
THBS4P35443 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
THBS4P35443 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
THBS4P35443 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
THBS4P35443 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
THBS4P35443 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
THBS4P35443 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
THBS4P35443 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
THBS4P35443 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
THBS4P35443 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
THBS4P35443 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
THBS4P35443 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
THBS4P35443 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
THBS4P35443 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
THBS4P35443 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
THBS4P35443 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
THBS4P35443 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
THBS4P35443 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
THBS4P35443 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
THBS4P35443 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
THBS4P35443 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
THBS4P35443 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
THBS4P35443 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
THBS4P35443 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
THBS4P35443 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
THBS4P35443 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
THBS4P35443 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
THBS4P35443 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
THBS4P35443 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
THBS4P35443 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
THBS4P35443 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
THBS4P35443 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
THBS4P35443 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
THBS4P35443 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
THBS4P35443 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
THBS4P35443 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
THBS4P35443 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
THBS4P35443 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
THBS4P35443 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
THBS4P35443 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
THBS4P35443 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
THBS4P35443 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
THBS4P35443 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
THBS4P35443 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
THBS4P35443 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
THBS4P35443 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
THBS4P35443 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
THBS4P35443 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
THBS4P35443 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
THBS4P35443 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
THBS4P35443 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
THBS4P35443 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
THBS4P35443 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
THBS4P35443 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
THBS4P35443 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
THBS4P35443 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
THBS4P35443 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
THBS4P35443 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
THBS4P35443 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
THBS4P35443 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
THBS4P35443 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
THBS4P35443 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
THBS4P35443 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
THBS4P35443 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
THBS4P35443 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
THBS4P35443 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
THBS4P35443 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
THBS4P35443 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
THBS4P35443 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
THBS4P35443 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
THBS4P35443 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
THBS4P35443 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
THBS4P35443 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
THBS4P35443 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms