Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RDXP35241 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RDXP35241 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RDXP35241 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RDXP35241 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RDXP35241 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RDXP35241 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RDXP35241 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RDXP35241 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RDXP35241 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RDXP35241 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RDXP35241 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RDXP35241 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RDXP35241 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RDXP35241 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RDXP35241 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RDXP35241 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RDXP35241 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RDXP35241 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RDXP35241 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RDXP35241 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RDXP35241 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RDXP35241 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RDXP35241 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RDXP35241 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RDXP35241 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RDXP35241 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RDXP35241 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RDXP35241 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RDXP35241 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RDXP35241 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RDXP35241 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RDXP35241 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RDXP35241 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RDXP35241 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RDXP35241 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RDXP35241 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RDXP35241 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RDXP35241 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RDXP35241 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RDXP35241 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RDXP35241 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RDXP35241 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RDXP35241 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RDXP35241 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RDXP35241 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RDXP35241 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RDXP35241 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RDXP35241 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RDXP35241 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RDXP35241 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RDXP35241 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RDXP35241 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RDXP35241 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RDXP35241 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RDXP35241 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RDXP35241 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RDXP35241 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RDXP35241 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RDXP35241 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RDXP35241 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RDXP35241 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RDXP35241 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RDXP35241 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RDXP35241 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RDXP35241 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RDXP35241 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RDXP35241 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RDXP35241 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RDXP35241 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RDXP35241 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RDXP35241 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RDXP35241 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RDXP35241 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RDXP35241 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RDXP35241 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RDXP35241 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RDXP35241 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RDXP35241 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RDXP35241 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RDXP35241 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RDXP35241 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RDXP35241 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RDXP35241 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RDXP35241 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RDXP35241 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RDXP35241 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RDXP35241 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RDXP35241 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RDXP35241 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RDXP35241 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RDXP35241 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RDXP35241 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RDXP35241 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RDXP35241 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RDXP35241 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RDXP35241 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RDXP35241 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RDXP35241 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RDXP35241 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms