Protein–RNA interactions for Protein: P10144

GZMB, Granzyme B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMBP10144 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GZMBP10144 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GZMBP10144 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GZMBP10144 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GZMBP10144 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GZMBP10144 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GZMBP10144 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GZMBP10144 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GZMBP10144 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GZMBP10144 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GZMBP10144 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GZMBP10144 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GZMBP10144 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GZMBP10144 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GZMBP10144 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GZMBP10144 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GZMBP10144 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GZMBP10144 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GZMBP10144 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GZMBP10144 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GZMBP10144 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GZMBP10144 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GZMBP10144 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GZMBP10144 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GZMBP10144 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GZMBP10144 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GZMBP10144 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GZMBP10144 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GZMBP10144 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GZMBP10144 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GZMBP10144 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GZMBP10144 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GZMBP10144 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GZMBP10144 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GZMBP10144 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GZMBP10144 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GZMBP10144 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GZMBP10144 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GZMBP10144 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GZMBP10144 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GZMBP10144 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GZMBP10144 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GZMBP10144 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GZMBP10144 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GZMBP10144 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GZMBP10144 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GZMBP10144 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GZMBP10144 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GZMBP10144 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GZMBP10144 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GZMBP10144 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GZMBP10144 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GZMBP10144 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GZMBP10144 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GZMBP10144 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GZMBP10144 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GZMBP10144 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GZMBP10144 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GZMBP10144 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GZMBP10144 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GZMBP10144 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GZMBP10144 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GZMBP10144 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GZMBP10144 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GZMBP10144 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GZMBP10144 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GZMBP10144 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GZMBP10144 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GZMBP10144 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GZMBP10144 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GZMBP10144 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GZMBP10144 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GZMBP10144 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GZMBP10144 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GZMBP10144 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GZMBP10144 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GZMBP10144 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GZMBP10144 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GZMBP10144 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GZMBP10144 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GZMBP10144 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GZMBP10144 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GZMBP10144 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GZMBP10144 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GZMBP10144 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GZMBP10144 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GZMBP10144 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GZMBP10144 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GZMBP10144 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GZMBP10144 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GZMBP10144 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GZMBP10144 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GZMBP10144 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GZMBP10144 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GZMBP10144 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GZMBP10144 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GZMBP10144 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GZMBP10144 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GZMBP10144 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GZMBP10144 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms