Protein–RNA interactions for Protein: P0DL12

SMIM17, Small integral membrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM17P0DL12 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms