Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFNA4P05014 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms