Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DENRO43583 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DENRO43583 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DENRO43583 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DENRO43583 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DENRO43583 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DENRO43583 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DENRO43583 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DENRO43583 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DENRO43583 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DENRO43583 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DENRO43583 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DENRO43583 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DENRO43583 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DENRO43583 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DENRO43583 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DENRO43583 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DENRO43583 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DENRO43583 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DENRO43583 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DENRO43583 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DENRO43583 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DENRO43583 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DENRO43583 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DENRO43583 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DENRO43583 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DENRO43583 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DENRO43583 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DENRO43583 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DENRO43583 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DENRO43583 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DENRO43583 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DENRO43583 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DENRO43583 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DENRO43583 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DENRO43583 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DENRO43583 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DENRO43583 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DENRO43583 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DENRO43583 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DENRO43583 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DENRO43583 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DENRO43583 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DENRO43583 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DENRO43583 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DENRO43583 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DENRO43583 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DENRO43583 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DENRO43583 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DENRO43583 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DENRO43583 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DENRO43583 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DENRO43583 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DENRO43583 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DENRO43583 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DENRO43583 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DENRO43583 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DENRO43583 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DENRO43583 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DENRO43583 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DENRO43583 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DENRO43583 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DENRO43583 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DENRO43583 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DENRO43583 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DENRO43583 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DENRO43583 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DENRO43583 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DENRO43583 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DENRO43583 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DENRO43583 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DENRO43583 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DENRO43583 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DENRO43583 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DENRO43583 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DENRO43583 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DENRO43583 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DENRO43583 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DENRO43583 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DENRO43583 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DENRO43583 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DENRO43583 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DENRO43583 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DENRO43583 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DENRO43583 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DENRO43583 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DENRO43583 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DENRO43583 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DENRO43583 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DENRO43583 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DENRO43583 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DENRO43583 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DENRO43583 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DENRO43583 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DENRO43583 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DENRO43583 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DENRO43583 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DENRO43583 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DENRO43583 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DENRO43583 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms