Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 NAP1L1-213ENST00000548044 1339 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.882e-14■■■■□ 24.3
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PRPF4O43172 NAP1L1-221ENST00000551600 786 ntTSL 59.22□□□□□ -0.932e-14■■■■□ 24.3
PRPF4O43172 NAP1L1-207ENST00000547479 623 ntTSL 59.1□□□□□ -0.952e-14■■■■□ 24.3
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PRPF4O43172 NAP1L1-218ENST00000550934 851 ntTSL 54.67□□□□□ -1.662e-14■■■■□ 24.3
PRPF4O43172 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.672e-14■■■■□ 24.3
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PRPF4O43172 ABCF2-202ENST00000287844 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.941e-6■■■■□ 24.3
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PRPF4O43172 PRKRIP1-205ENST00000477886 986 ntTSL 1 (best)22.65■■□□□ 1.229e-10■■■■□ 24.2
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PRPF4O43172 EPS8L3-209ENST00000494151 630 ntTSL 213.62□□□□□ -0.235e-8■■■■□ 24.1
PRPF4O43172 VPS9D1-203ENST00000563798 459 ntTSL 316.39■□□□□ 0.214e-7■■■■□ 24.1
PRPF4O43172 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.084e-7■■■■□ 24.1
PRPF4O43172 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.853e-7■■■■□ 24.1
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