Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 RAPGEF6-209ENST00000510071 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 SPIN1-201ENST00000375859 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 PAMR1-206ENST00000615849 2801 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 LINC00969-212ENST00000445430 4208 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 KDM4D-202ENST00000536741 2737 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 KRBA1-201ENST00000319551 4020 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ELOVL5-202ENST00000370913 580 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC026304.1-201ENST00000597953 561 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC034229.3-201ENST00000606203 2436 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 LINGO4-201ENST00000368820 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ITIH3-201ENST00000416872 2220 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 DAPK1-213ENST00000491893 4186 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ZFP1-203ENST00000464850 3067 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC091167.3-201ENST00000561573 3838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 APOBEC3C-201ENST00000361441 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 SEC61A1-203ENST00000464451 1871 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 FAM238C-202ENST00000639963 1787 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ATP2A1-202ENST00000395503 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 STAT1-201ENST00000361099 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC007389.3-201ENST00000420724 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 SLC7A7-204ENST00000397532 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ABLIM1-204ENST00000369256 3203 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 NTRK2-208ENST00000395882 7111 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 LRRK2-202ENST00000343742 4740 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 KRT18P40-201ENST00000599859 1571 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 VWA3B-221ENST00000614454 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AL354919.1-201ENST00000453837 2257 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ASPH-203ENST00000379454 5268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 CHRM1-201ENST00000306960 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 NPY2R-201ENST00000329476 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 CLSTN3-207ENST00000537408 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 PXMP4-203ENST00000409299 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AL591742.2-201ENST00000632517 2119 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 PSG9-201ENST00000244293 2073 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 NHP2-201ENST00000274606 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 MS4A13-202ENST00000378186 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 USF1-203ENST00000368021 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 LRRC8A-202ENST00000372599 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 LILRA2-202ENST00000251377 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 CPA5-203ENST00000461828 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 CDCA8-201ENST00000327331 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 PRAMEF6-201ENST00000376189 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 PRAMEF6-202ENST00000415464 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 PRAMEF5-201ENST00000622421 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 COPS4-206ENST00000509093 2273 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 ZNF550-205ENST00000457177 3376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 PRAMEF14-201ENST00000334600 1690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 OSBPL9-207ENST00000462759 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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