Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCHIP1Q9P0W5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms