Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.376e-7■■■■■ 301.1
UTP3Q9NQZ2 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.676e-7■■■■■ 301.1
UTP3Q9NQZ2 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 300.8
UTP3Q9NQZ2 MYBBP1A-202ENST00000381556 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.451e-6■■■■■ 300.8
UTP3Q9NQZ2 MYBBP1A-207ENST00000573116 3795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)11.33□□□□□ -0.61e-6■■■■■ 300.8
UTP3Q9NQZ2 PPARA-203ENST00000407236 9995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.912e-10■■■■■ 300.5
UTP3Q9NQZ2 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.535e-8■■■■■ 299.9
UTP3Q9NQZ2 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.245e-8■■■■■ 299.9
UTP3Q9NQZ2 FYCO1-201ENST00000296137 8504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.335e-8■■■■■ 299.9
UTP3Q9NQZ2 FYCO1-202ENST00000433878 4317 ntTSL 29.12□□□□□ -0.955e-8■■■■■ 299.9
UTP3Q9NQZ2 TUBGCP4-202ENST00000561691 1928 ntTSL 1 (best)11□□□□□ -0.651e-10■■■■■ 299.7
UTP3Q9NQZ2 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.045e-7■■■■■ 299.6
UTP3Q9NQZ2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.864e-7■■■■■ 299.4
UTP3Q9NQZ2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.844e-7■■■■■ 299.4
UTP3Q9NQZ2 PLCB1-224ENST00000636319 2930 ntTSL 520.28■□□□□ 0.844e-7■■■■■ 299.4
UTP3Q9NQZ2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.744e-7■■■■■ 299.4
UTP3Q9NQZ2 PLCB1-214ENST00000626161 706 ntTSL 517.65■□□□□ 0.424e-7■■■■■ 299.4
UTP3Q9NQZ2 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.174e-7■■■■■ 299.4
UTP3Q9NQZ2 CAPRIN2-206ENST00000534897 478 ntTSL 45.7□□□□□ -1.55e-25■■■■■ 298.9
UTP3Q9NQZ2 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.312e-7■■■■■ 298.6
UTP3Q9NQZ2 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.242e-7■■■■■ 298.6
UTP3Q9NQZ2 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.212e-7■■■■■ 298.6
UTP3Q9NQZ2 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 298.6
UTP3Q9NQZ2 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.112e-7■■■■■ 298.6
UTP3Q9NQZ2 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.032e-7■■■■■ 298.6
UTP3Q9NQZ2 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 298.6
UTP3Q9NQZ2 IKZF1-201ENST00000331340 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.152e-7■■■■■ 298.6
UTP3Q9NQZ2 IKZF1-210ENST00000439701 3572 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.422e-7■■■■■ 298.6
UTP3Q9NQZ2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.562e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 SULT4A1-202ENST00000422525 2561 ntTSL 1 (best)29.2■■■□□ 2.272e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.962e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.852e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.822e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.752e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.722e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.642e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.622e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 C9orf3-215ENST00000478473 895 ntTSL 324.79■■□□□ 1.564e-8■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.562e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 KLHDC9-207ENST00000490724 1038 ntTSL 524.77■■□□□ 1.562e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 KLHDC9-208ENST00000494418 581 ntTSL 524.77■■□□□ 1.562e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.553e-6■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 MCM2-208ENST00000480910 693 ntTSL 224.64■■□□□ 1.542e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 ACYP2-205ENST00000458030 1330 ntTSL 324.63■■□□□ 1.532e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.52e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.492e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 C7orf43-203ENST00000419037 2200 ntTSL 524.28■■□□□ 1.482e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.472e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.462e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 C9orf3-213ENST00000471978 478 ntTSL 223.9■■□□□ 1.424e-8■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.392e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.373e-6■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.342e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.342e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.342e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.252e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.232e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.232e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 MIDN-203ENST00000586843 416 ntTSL 222.73■■□□□ 1.232e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.193e-6■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 KLHDC9-205ENST00000471613 776 ntTSL 222.49■■□□□ 1.192e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.182e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 KLHDC9-204ENST00000469647 921 ntTSL 322.44■■□□□ 1.182e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 MCM2-203ENST00000468659 557 ntTSL 422.44■■□□□ 1.182e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.163e-6■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 PDE4A-205ENST00000586275 695 ntTSL 322.3■■□□□ 1.163e-35■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.143e-6■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 TMEM44-207ENST00000430601 682 ntTSL 322.06■■□□□ 1.123e-6■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.112e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.112e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 TUBGCP6-202ENST00000425018 1509 ntTSL 1 (best)21.87■■□□□ 1.092e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.092e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 KPTN-205ENST00000595554 806 ntTSL 321.82■■□□□ 1.082e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 GCDH-214ENST00000591043 1764 ntTSL 521.79■■□□□ 1.088e-7■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 DMTN-211ENST00000518816 997 ntTSL 221.69■■□□□ 1.062e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.062e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 TENM3-205ENST00000512480 651 ntTSL 321.65■■□□□ 1.062e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.053e-6■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 PDE4A-206ENST00000589073 1703 ntTSL 521.19■□□□□ 0.983e-35■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.962e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 KPTN-203ENST00000594208 1623 ntTSL 220.94■□□□□ 0.942e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.933e-6■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 DCTN1-211ENST00000437375 598 ntTSL 420.83■□□□□ 0.932e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 GCDH-202ENST00000421816 1109 ntTSL 220.68■□□□□ 0.98e-7■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 LINC00847-203ENST00000502162 1809 ntTSL 1 (best)20.32■□□□□ 0.842e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 GTPBP1-202ENST00000418601 810 ntTSL 220.3■□□□□ 0.842e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.848e-7■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.842e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.832e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.832e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.822e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.821e-6■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 FLYWCH2-205ENST00000573965 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 220.06■□□□□ 0.82e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 CCDC43-205ENST00000592333 692 ntTSL 219.91■□□□□ 0.782e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.783e-35■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.782e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 CPSF2-203ENST00000554290 558 ntTSL 419.82■□□□□ 0.762e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 PPP1R13L-203ENST00000585905 2176 ntTSL 219.73■□□□□ 0.758e-16■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.742e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.741e-9■■■■■ 298.1
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 383.6 ms