Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms