Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK7

SKA2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA2Q8WVK7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKA2Q8WVK7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SKA2Q8WVK7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SKA2Q8WVK7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKA2Q8WVK7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKA2Q8WVK7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKA2Q8WVK7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKA2Q8WVK7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKA2Q8WVK7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKA2Q8WVK7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKA2Q8WVK7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKA2Q8WVK7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKA2Q8WVK7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKA2Q8WVK7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKA2Q8WVK7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKA2Q8WVK7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKA2Q8WVK7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKA2Q8WVK7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKA2Q8WVK7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKA2Q8WVK7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKA2Q8WVK7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKA2Q8WVK7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms