Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSA7

LRRC55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC55Q6ZSA7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC55Q6ZSA7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.3 ms