Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms